1、商鞅变法轻视教化，鼓吹轻罪重罚。商鞅制定的法律非常严苛，如百姓在路边倒垃圾，就要被砍去双手。

2、商鞅变法在一定程度上加重了广大人民所受的剥削与压迫，特别是连坐法，给广大人民带来巨大的痛苦。

3、商鞅变法也并未与旧的制度、文化、习俗彻底划清界限。例如，变法条文中明文规定按爵位等级占有数额不同的田宅和奴隶，公开承认占有奴隶的合法性。等等

4、重农抑商政策，刚开始有利于封建经济的发展，但到后来阻碍了商品经济的发展。

5、燔诗书而明法令，牵制了人们的思维，是一种文化专制，抑制了创新意识。